急性骨髓炎的自然病程可以维持3～4星期。脓肿穿破后疼痛即刻缓解，体温逐渐下降，脓肿穿破后形成窦道，病变转入慢性阶段。同时施行全身支持疗法，包括高蛋白饮食、维生素、输血等，患肢进行牵引或石膏制动，达到减少痛苦，防止病理骨折。急性骨髓炎患者一旦穿刺有脓或高热不退，中毒症状严重要及时切开排脓。
　　
　　部分病例致病菌毒性较低，特别是白色葡萄球菌所致的骨髓炎，表现很不典型，缺乏高热与中毒性症状，体征也较轻，诊断比较困难。
　　
急性骨髓炎的治疗
　　　
　　由于诊断不及时，急性骨髓炎往往演变为慢性骨髓炎，使医疗费用明显增加。因此治疗的目的应该中断骨髓炎由急性期趋向于慢性阶段，早期诊断与治疗是主要的关键。
　　
　　1. 抗生素治疗
　　
　　对疑有骨髓炎的病例应立即开始足量抗生素治疗，在发病5天内使用往往可以控制炎症，而在5天后使用或细菌对所用抗生素不敏感时，都会影响疗效。由于致病菌大都为溶血性金黄色葡萄球菌，要联合应用抗生素，选用的抗生素一种针对革兰阳性球菌，而另一种则为广谱抗生素，待检出致病菌后再予以调整。近年来，由于耐药菌株日渐增多，因此选择合适时期进行手术很有必要。
　　
　　2. 手术治疗
　　
　　手术的目的：①引流脓液，减少毒血症症状；②阻止急性骨髓炎转变为慢性骨髓炎。
　　
　　专家指出：急性骨髓炎患者手术治疗宜早，最好在抗生素治疗后48～72小时仍不能控制局部症状时进行手术，也有主张提前为36小时的。延迟的手术只能达到引流的目的，不能阻止急性骨髓炎向慢性阶段演变。