慢性骨髓炎骨营养中断，造成骨坏死，易形成死骨，仅用中药及抗生素大多不能治愈，多数应手术治疗。骨髓内形成脓肿、骨髓内压力增高，骨髓内血流中断，骨膜下形成脓肿而致骨坏死、病理骨折、甚至大段骨坏死造成的骨缺损。
　　
　　临床上多伴有继发瘘孔，反复排脓。如瘘孔闭塞，局部就会发热、肿痛、淋巴结肿大、全身发热、白血球增高和血沉加快等。如长年瘘孔不闭，极有可能会发生瘘孔区组织癌变，而不得不截肢。
　　
　　慢性骨髓炎，经久不愈的瘘孔，由于脓汁的刺激，瘘孔周围的组织会发生变性，成为癌变。此时，骨皮质也会发生癌变。癌变前的症状主要有：1.瘘口分泌物增多，恶臭；2.创面糜烂，增大，不论用任何药物，无收口的现象。3.肉芽呈火山状，容易出血，出血后不易制止；4.肉芽附着白色的汾泌物，红白间隔成菜花状；5.骨质的X线变化，为迅速的骨质疏松，恶变，甚至病理骨折，长管骨及骨干骨小梁消失，骨破坏；6.疼痛时是难以忍受的症状。有时打杜冷丁也不能止痛。
　　
　　各种中西药和抗生素的治疗都是失败，截肢是唯一保全性命，解除痛苦的方法。我们的专家曾经遇到过多例瘘孔癌变的患者，以前早年是穷人没钱看病而癌变，近年来多是由于病人患者疏忽或家属没有得到足够重视而导致没有及时治疗骨髓炎瘘孔发生癌变。截除肢体后，虽然患者保住生命，解除病痛，但因缺肢从而引起心理障碍。因此，对慢性骨髓炎的长期瘘道不愈，应该时刻防止癌变，做出恰当的治疗。瘘孔的癌变率是1%--3%。